Основними завданнями планово-фінансового відділу є: участь у перспективному та поточному плануванні підготовки спеціалістів в університеті; планування та організація фінансової діяльності університету; складання перспективних та річних кошторисів витрат і планів використання коштів загального та спеціального фондів згідно з діючими нормативними документами.

До обов’язків працівників відділу належать розрахунки ціни платних послуг університету та вдосконалення методик обрахування вартості платних послуг.

Спільно з бухгалтерією та іншими підрозділами університету працівники планово-фінансового відділу забезпечують раціональне й ефективне використання коштів загального та спеціального фондів університету; розробляють заходи щодо вдосконалення системи планування та фінансування університету, системи матеріального забезпечення підрозділів, стимулювання, преміювання і матеріальної допомоги співробітникам, студентам, аспірантам та клінічним ординаторам.